在三国志战略版中打造强大的船只系统需要从基础建造、舰船类型选择、技术升级和实战应用四个维度进行规划。首先需解锁船坞功能，这是造船的前提条件，基础舰船走舸可自动获得，无需专门建造。通过升级船坞可解锁更高级的蒙冲、斗舰、楼船等舰船，不同舰船具备乘浪、飞扬、猛进等特性，分别提升行军速度、战斗属性或特殊效果。船只的建造和升级需消耗同盟资源，且被击败后需重新建造，因此资源管理和舰队保护至关重要。
基础舰船走舸属性平庸但无需成本，适合初期过渡；蒙冲擅长速度加成，适合快速突袭；斗舰具备缠斗特性可恢复伤兵，适合持久战；楼船拥有攻城值加成和适性提升，是后期攻坚的核心。旗舰作为特殊舰船需同盟集体资源建造，守军被击杀后会暂时失效但可自动恢复，需重点防护。舰船搭配应考虑三艘同类型组合，避免属性平均化导致的效率损失。
船只技术的研发是提升战斗力的关键。掠敌技术能有效提升满红账号的作战收益，接舷技术可增强近战能力，而焚舟技术则提供战术性破坏手段。巡航和御敌技术侧重辅助功能，适用于特定战场环境。技术选择需根据队伍配置调整，例如先攻队伍可放弃渡江技术，转而强化输出或防御类指令。技术指令可随时更换，但需注意每次更换存在冷却时间，频繁切换可能影响战术连贯性。
每位武将拥有从C到S的水军适性等级，属性加成差异可达10%，可通过操练点提升。善水改装能直接提升一级适性，而水上作战、拆除耐久等行动能积累操练点。建议优先为主力武将提升适性，搭配善水改装形成属性压制。水寨建设可提供稳定的操练点来源，同时解锁舰船改装功能，通过神行、坚韧等改装进一步提升舰船专项能力。
炮击舰队推荐以射程优势为核心，搭配1440-2880射程的混编阵型；近战舰队需注重耐久与冲锋能力，可配置先民突击舰作为前排防线。港口建设中建议保留14能量、5石料的基础配置，确保资源产出与舰队维护的平衡。后期可优先建造黑珍珠、飞翔的荷兰人等特殊舰船，其速度和仓容属性对商业与战斗均有显著提升。
