捕捉火红版的三圣兽首先需要完成游戏的主线剧情，击败四大天王和冠军，这是触发三圣兽出现的基本条件。雷公、炎帝和水君会在关东地区的草地中随机出现，但具体遇到哪一只取决于玩家最初选择的御三家精灵，选择妙蛙种子会遇见炎帝，选择小火龙会遇见水君，而选择杰尼龟会遇见雷公，因此玩家无法在同一游戏中捕捉全部三只。
由于三圣兽在遭遇后会立即使用吼叫技能逃跑，玩家必须提前准备好特定的宝可梦和道具来应对。推荐使用等级60以上的耿鬼，因为它是鬼系精灵，吼叫对其无效，并且耿鬼应学会黑暗眼神以防止三圣兽逃跑，同时配备催眠术、食梦或恶梦以及影子球等技能来削弱对方。耿鬼可以装备余物道具，在战斗中自动回复HP，以维持生存能力。准备大量的超级球和补HP药是必要的，因为捕捉过程可能需要多次尝试。
当在草地中随机遇到三圣兽时，要立即让耿鬼使用黑暗眼神技能，这样三圣兽就无法逃跑。使用催眠术使对方陷入睡眠状态，然后用食梦、恶梦或影子球等攻击技能逐渐消耗它的HP，直到将其HP降低到红色或黄色状态，这样可以大大增加精灵球的捕获成功率。注意避免将三圣兽打倒，否则捕捉会失败。
为了提高精灵球的捕获率，在投掷球时可以同时按住方向键的左、下和A键，这种方法相比单纯按A键能有效提升捕捉同一种精灵的概率。建议优先使用超级球等高级球类，因为它们的基础捕获率更高，同时携带足够的恢复道具如伤药和状态回复药，以确保队伍在长期战斗中保持稳定。
由于三圣兽会随机变换栖息地，如果在一段选定的草丛中长时间没有遇到，玩家可以重启游戏并读取之前的存档，然后在同一区域反复尝试，直到遭遇目标。选择一片地形较好的草丛区域，并在进入前存档记录，这样可以节省时间并提高效率。耐心和持续尝试是成功捕捉三圣兽的关键，因为它们的出现具有随机性。
